Stopień kompresji pliku JPEG można ustawić na trzy sposoby: Fine (1:4), Normal (1:8) i Basic (1:16). Zmiany w ostrości, kontraście, jasności czy nasyceniu mogą być regulowane w analogiczny sposób jak w D300: automatycznie przez aparat, lub w zakresie od 0 do 9. Ustawienia te, zapisywane są pod nazwą typu obrazu: Standard, Neutral, Monochrom lub Vivid.

Testowe zdjęcia scenki uzyskane dla plików JPG i dla całego zakresu czułości wykonane zostały przy ustawieniach neutralnych (wyostrzanie w stopniu minimalnym). Zakres czułości w D3 jest bardzo szeroki. Zawiera się od 100 do 25600 ISO z minimalnym skokiem 1/3 EV. Rzeczywisty zakres czułości wynosi jednak 200-6400 ISO, natomiast pozostałe wartości są sztucznie obniżane lub podciągane. Technologia matryc CMOS opracowana przez Nikona z jakichś powodów ma problemy z najniższymi czułościami. Podobna sytuacja jest w D300, gdzie także nie ma prawdziwego 100 ISO. Być może jest to cena za dobre zachowanie na wyższych czułościach, ale biorąc pod uwagę profesjonalizm aparatu, wymagać należałoby nawet czułości 50 ISO, jak to jest na przykład w Canonie 5D. W zamian jednak Nikon rozszerza górny zakres ISO. Jakość całego zakresu na plikach JPEG można ocenić poniżej.

50 ISO
5D
100 ISO
D3
5D
D300
200 ISO
D3
5D
D300
400 ISO
D3
5D
D300
800 ISO
D3
5D
D300
1600 ISO
D3
5D
D300
3200 ISO
D3
5D
D300
6400 ISO
D3
D300
12800 ISO
D3
25600 ISO
D3

Zdjęcia zapisane jako JPEG nie pokazują pełnych możliwości aparatu. Często jednak większość wykonywanych ujęć zapisywanych jest właśnie w tym formacie, dlatego warto się przyjrzeć co oferuje aparat w tym względzie. Rzut oka wystarczy by zobaczyć bardzo dobrą jakość zdjęć D3 aż do czułości 3200-6400 ISO. Nawet tak skrajne wartości jak 12800 i 25600 ISO są użyteczne. Porównanie do również pełnoklatkowego Canona 5D nie pokazuje dużych różnic w jakości zdjęć. Przewagę D3 widać jednak nad D300, który posiada matrycę APS-C, a więc o mniejszych rozmiarach, ale o podobnej liczbie pikseli. W tym przypadku szum na D300 staje się wyraźniejszy niż w D3 już od 800 ISO. Można tu mówić o względnej różnicy w ilości szumu na poziomie 1-1.5 EV. Obraz z D300 na czułości 6400 jest podobnej jakości jak obraz z D3 na czułości 12600 ISO.

Wizualnie, lepszą jakość zdjęć zapisanych jako JPEG, można uzyskać poprzez wyostrzenie. D3 posiada 10-stopniową skalę regulacji tego parametru (od 0 do 9). Przykład wyostrzenia 0, 4 i 9 pokazujemy poniżej.

D3, 100 ISO
wyostrzenie 0
wyostrzenie 4
wyostrzenie 9